Poderão candidatar-se a bolsas os alunos regulares sem vínculo empregatício, levando-se em conta os critérios estabelecidos pelas agências financiadoras e pela Comissão de Bolsas do Curso (conforme Resolução PPGECB 012/2019). A duração das bolsas é de, no máximo, 24 meses para o mestrado e 48 meses para o doutorado.

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A aceitação pelo orientador ou a aprovação no processo seletivo não implica na concessão automática de bolsa. No entanto, os professores orientadores, em colaboração com a Coordenação do Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade, sempre buscam obter bolsas junto a agências de fomento (CAPES, FAPESB e CNPq). O curso também fomenta, por meio de dicas, cursos e até mesmo disciplinas, iniciativas individuais de obtenção de financiamento para a pesquisa.